Projektitoiminta on osa kehittämispalveluita, jota johtaa kehittämisjohtaja Kirsi Mikkola. Omnian projektit keskittyvät mm. yrittäjyyskasvatukseen, syrjäytymisen ehkäisyyn ja ohjaukseen, työssäoppimiseen, oppimisympäristöjen ja opetusmenetelmien kehittämiseen ja kansainvälisyyteen. Käynnissä on useita ESR-hankkeita ja Opetushallituksen rahoittamia kehittämisprojekteja. Omnia osallistuu projektitoimintaan sekä koordinaattorina että kumppanina.
Omnian julkaisusarjassa julkaistut projektien loppuraportit löytyvät Omnian viestinnän sivuilta, ks. linkki sivun oikeassa palstassa. Päättyneiden projektien kuvauksia löytyy sivulta Päättyneet projektit.